在此之前，因为“联蒙抗夷”的政策没有得到朝廷的背书，与林丹汗进行联系的一直是辽东的地方官员，所以这将是明朝中央政府与其直接开展的首次官方外交活动。虽然这次战争中林丹汗更多的作用是锦上添花，但能有一份借力总是好的；而最直接促使朱由校如此行动的，是因为陕西都指挥使司发来情报：二十五日，有河套部落进犯延绥。
自元朝灭亡之后，蒙古分裂为许多部，其中势力最大、维持时间最长的三大部分：科尔沁郎漠南蒙古，喀尔喀部漠北蒙古，厄鲁特部漠西蒙古。然而蒙古部族不足以远远不止这三个，而这三大部在历史上其内部也是长期分裂的。
而林丹汗就是蒙古大汗，漠南蒙古名义上的领袖，察哈尔部的可汗。他自继位以来，就不断增加对本部的控制力，通过战争的手段意图事实上的控制整个漠南蒙古，最终完成统一整个蒙古，重回成吉思汗时代荣光的野心。
但是他的野心仅在第二步便夭折了，在他成功的统一了本部察哈尔部后，因为将信仰从黄教改为红教，导致了与其他信仰黄教的漠南蒙古部落交恶，虽然后来通过武力手段一度实际控制了内喀尔喀五族，但也因此彻底被其他漠南蒙古部落所忌惮，害怕被其吞并；后来，原本与林丹汗交好的科尔沁、内喀尔喀等部落与努尔哈赤联姻，被后金挖了墙角，于是又与后金交恶，彻底的四面树敌了。
虽然林丹汗的实力比任何一个漠南部落都要强，但一虎难抵群狼；而与后金相比，它又属于弱势的一方，在这种被包围的情况下，林丹汗只能选择与大明交好。
而大明也一直有联络蒙古之心，拉拢少数民族部落成为自己的潘屏、卫所，是大明一直以来的传统。自十几年前叶赫部覆灭后，大明在东北方面的藩屏就彻底名存实亡了，此时的林丹汗已成为了一个非常优秀的选项。